Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms