Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PXDC1Q5TGL8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms