Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms