Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms