Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ESCO2Q56NI9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms