Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms