Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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