Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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