Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PMS2P3Q13401 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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