Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 STX4-211ENST00000493902 1588 ntTSL 525.22■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MCRS1-209ENST00000549000 1074 ntTSL 224.63■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SH3BP5-204ENST00000412806 1900 ntTSL 524.04■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-204ENST00000441818 1793 ntTSL 1 (best)23.96■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-205ENST00000453630 1775 ntTSL 223.11■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)23.09■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-207ENST00000457572 1882 ntTSL 223.09■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-203ENST00000381021 1830 ntTSL 223.08■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PPM1J-203ENST00000471106 1496 ntTSL 1 (best)22.28■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SIRT3-211ENST00000529937 2627 ntTSL 522.02■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.063e-12■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CARD9-204ENST00000481053 4060 ntTSL 219.62■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)19.1■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 DUS3L-212ENST00000592468 797 ntTSL 518.61■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 STX4-213ENST00000503629 1377 ntTSL 418.59■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-210ENST00000470831 1860 ntTSL 218.31■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 417.99■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CARD9-205ENST00000485975 4574 ntTSL 217.81■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DUS3L-205ENST00000589841 453 ntTSL 217.76■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TTC28-AS1-210ENST00000430525 524 ntTSL 417.6■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CYB5R2-210ENST00000532621 499 ntTSL 216.79■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DUS3L-204ENST00000589085 2301 ntTSL 516.59■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 HINT2-207ENST00000490578 717 ntTSL 216.52■□□□□ 0.243e-12■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CC2D1B-207ENST00000470844 728 ntTSL 516.36■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-216ENST00000491612 2933 ntTSL 216.04■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 STX4-206ENST00000468583 564 ntTSL 515.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TTC28-AS1-217ENST00000452612 746 ntTSL 315.87■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MRPS27-204ENST00000508863 956 ntTSL 315.87■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 TTC28-AS1-211ENST00000430853 564 ntTSL 415.39■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DUS3L-214ENST00000592673 701 ntTSL 215.32■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TRMU-214ENST00000485559 2653 ntTSL 215.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 RELT-207ENST00000545886 4346 ntTSL 215.04■□□□□ -01e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TTC28-AS1-203ENST00000419253 846 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TTC28-AS1-218ENST00000453632 562 ntTSL 414.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CC2D1B-203ENST00000438021 2521 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DPCD-201ENST00000370147 641 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MYL9-202ENST00000346786 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 NFYB-201ENST00000240055 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 RELT-204ENST00000539134 3244 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MAPK3-209ENST00000478356 961 ntTSL 513.75□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 HSD17B7-208ENST00000485405 2541 ntTSL 213.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DPCD-205ENST00000475443 731 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DPCD-203ENST00000434727 369 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 XPNPEP1-203ENST00000369683 2344 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 AC108488.1-201ENST00000422961 791 ntTSL 213.35□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 STX4-214ENST00000564368 561 ntTSL 413.29□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TIMM22-201ENST00000327158 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CAMTA2-212ENST00000574951 4431 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DPCD-206ENST00000626968 541 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 ECM1-204ENST00000470432 3066 ntTSL 213.11□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TBRG1-201ENST00000284290 4468 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 28.5
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