Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SELENBP1Q13228 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms