Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELF3P78545 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELF3P78545 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELF3P78545 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELF3P78545 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ELF3P78545 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ELF3P78545 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms