Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCL23P55773 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCL23P55773 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL23P55773 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL23P55773 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL23P55773 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL23P55773 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL23P55773 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL23P55773 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL23P55773 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL23P55773 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL23P55773 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL23P55773 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL23P55773 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL23P55773 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms