Protein–RNA interactions for Protein: P54687

BCAT1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAT1P54687 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAT1P54687 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms