Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNS1AP54105 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLNS1AP54105 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNS1AP54105 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNS1AP54105 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNS1AP54105 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNS1AP54105 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNS1AP54105 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNS1AP54105 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNS1AP54105 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLNS1AP54105 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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