Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DAP3P51398 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms