Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PXNP49023 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PXNP49023 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXNP49023 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PXNP49023 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXNP49023 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXNP49023 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXNP49023 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXNP49023 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXNP49023 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXNP49023 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXNP49023 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXNP49023 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXNP49023 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PXNP49023 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PXNP49023 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PXNP49023 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PXNP49023 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PXNP49023 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXNP49023 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXNP49023 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms