Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSBP45954 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms