Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1D1P20393 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms