Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREB1P16220 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREB1P16220 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB1P16220 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB1P16220 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB1P16220 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB1P16220 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB1P16220 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms