Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPBP07199 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPBP07199 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPBP07199 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPBP07199 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPBP07199 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPBP07199 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPBP07199 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPBP07199 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPBP07199 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPBP07199 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPBP07199 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPBP07199 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPBP07199 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPBP07199 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPBP07199 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPBP07199 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPBP07199 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPBP07199 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPBP07199 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms