Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX4O95219 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX4O95219 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX4O95219 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX4O95219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX4O95219 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX4O95219 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX4O95219 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX4O95219 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX4O95219 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms