Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCATO75600 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCATO75600 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCATO75600 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCATO75600 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCATO75600 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCATO75600 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCATO75600 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms