Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIAH2O43255 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIAH2O43255 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms