Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBDO15205 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBDO15205 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBDO15205 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBDO15205 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBDO15205 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBDO15205 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBDO15205 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBDO15205 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBDO15205 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBDO15205 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBDO15205 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBDO15205 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBDO15205 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBDO15205 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBDO15205 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms