Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms