Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BRM9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3BRM9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3BRM9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3BRM9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3BRM9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3BRM9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3BRM9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3BRM9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3BRM9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms