Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BQV1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BQV1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BQV1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BQV1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BQV1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BQV1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BQV1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BQV1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H3BQV1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H3BQV1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms