Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PABPN1LA6NDY0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPN1LA6NDY0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms