Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RQJ8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQJ8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms