Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD54BQ9Y620 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD54BQ9Y620 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54BQ9Y620 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54BQ9Y620 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD54BQ9Y620 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54BQ9Y620 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54BQ9Y620 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms