Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y616

IRAK3, Interleukin-1 receptor-associated kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK3Q9Y616 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRAK3Q9Y616 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRAK3Q9Y616 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRAK3Q9Y616 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRAK3Q9Y616 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IRAK3Q9Y616 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRAK3Q9Y616 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRAK3Q9Y616 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRAK3Q9Y616 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRAK3Q9Y616 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRAK3Q9Y616 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRAK3Q9Y616 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRAK3Q9Y616 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRAK3Q9Y616 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRAK3Q9Y616 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRAK3Q9Y616 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRAK3Q9Y616 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRAK3Q9Y616 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms