Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L3Q9Y2J2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L3Q9Y2J2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L3Q9Y2J2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41L3Q9Y2J2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPB41L3Q9Y2J2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPB41L3Q9Y2J2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L3Q9Y2J2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPB41L3Q9Y2J2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41L3Q9Y2J2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPB41L3Q9Y2J2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390 ms