Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFR2Q9UP52 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TFR2Q9UP52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TFR2Q9UP52 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TFR2Q9UP52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFR2Q9UP52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFR2Q9UP52 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFR2Q9UP52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFR2Q9UP52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFR2Q9UP52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFR2Q9UP52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms