Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPN11Q9UMQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN11Q9UMQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN11Q9UMQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN11Q9UMQ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAPN11Q9UMQ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN11Q9UMQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN11Q9UMQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms