Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC50.12■■■■■ 5.61
ATAD2BQ9ULI0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC50.12■■■■■ 5.61
ATAD2BQ9ULI0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
ATAD2BQ9ULI0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
ATAD2BQ9ULI0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC50.1■■■■■ 5.61
ATAD2BQ9ULI0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
ATAD2BQ9ULI0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
ATAD2BQ9ULI0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC50.03■■■■■ 5.6
ATAD2BQ9ULI0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
ATAD2BQ9ULI0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
ATAD2BQ9ULI0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
ATAD2BQ9ULI0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ATAD2BQ9ULI0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
ATAD2BQ9ULI0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
ATAD2BQ9ULI0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
ATAD2BQ9ULI0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
ATAD2BQ9ULI0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
ATAD2BQ9ULI0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
ATAD2BQ9ULI0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC49.88■■■■■ 5.57
ATAD2BQ9ULI0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC49.88■■■■■ 5.57
ATAD2BQ9ULI0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
ATAD2BQ9ULI0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
ATAD2BQ9ULI0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
ATAD2BQ9ULI0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
ATAD2BQ9ULI0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC49.82■■■■■ 5.57
ATAD2BQ9ULI0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
ATAD2BQ9ULI0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
ATAD2BQ9ULI0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.78■■■■■ 5.56
ATAD2BQ9ULI0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
ATAD2BQ9ULI0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC49.76■■■■■ 5.56
ATAD2BQ9ULI0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC49.75■■■■■ 5.55
ATAD2BQ9ULI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
ATAD2BQ9ULI0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC49.72■■■■■ 5.55
ATAD2BQ9ULI0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
ATAD2BQ9ULI0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
ATAD2BQ9ULI0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
ATAD2BQ9ULI0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC49.69■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC49.68■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC49.67■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC49.67■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC49.64■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
ATAD2BQ9ULI0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
ATAD2BQ9ULI0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
ATAD2BQ9ULI0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
ATAD2BQ9ULI0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
ATAD2BQ9ULI0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
ATAD2BQ9ULI0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.51■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC49.5■■■■■ 5.52
ATAD2BQ9ULI0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
ATAD2BQ9ULI0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
ATAD2BQ9ULI0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC49.47■■■■■ 5.51
ATAD2BQ9ULI0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
ATAD2BQ9ULI0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC49.46■■■■■ 5.51
ATAD2BQ9ULI0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
ATAD2BQ9ULI0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.5
ATAD2BQ9ULI0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
ATAD2BQ9ULI0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC49.42■■■■■ 5.5
ATAD2BQ9ULI0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
ATAD2BQ9ULI0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC49.41■■■■■ 5.5
ATAD2BQ9ULI0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.4■■■■■ 5.5
ATAD2BQ9ULI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
ATAD2BQ9ULI0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
ATAD2BQ9ULI0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
ATAD2BQ9ULI0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC49.35■■■■■ 5.49
ATAD2BQ9ULI0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
ATAD2BQ9ULI0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
ATAD2BQ9ULI0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
ATAD2BQ9ULI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
ATAD2BQ9ULI0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.48
ATAD2BQ9ULI0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC49.25■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC49.21■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC49.2■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC49.2■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC49.2■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
ATAD2BQ9ULI0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.19■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC49.17■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
ATAD2BQ9ULI0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms