Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXL3Q9UKT7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXL3Q9UKT7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXL3Q9UKT7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXL3Q9UKT7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXL3Q9UKT7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXL3Q9UKT7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXL3Q9UKT7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXL3Q9UKT7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXL3Q9UKT7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXL3Q9UKT7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXL3Q9UKT7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL3Q9UKT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXL3Q9UKT7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL3Q9UKT7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXL3Q9UKT7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL3Q9UKT7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXL3Q9UKT7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXL3Q9UKT7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms