Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GJD2Q9UKL4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD2Q9UKL4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJD2Q9UKL4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJD2Q9UKL4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJD2Q9UKL4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD2Q9UKL4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJD2Q9UKL4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJD2Q9UKL4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD2Q9UKL4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD2Q9UKL4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJD2Q9UKL4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD2Q9UKL4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD2Q9UKL4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJD2Q9UKL4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJD2Q9UKL4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJD2Q9UKL4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJD2Q9UKL4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GJD2Q9UKL4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJD2Q9UKL4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJD2Q9UKL4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD2Q9UKL4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD2Q9UKL4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD2Q9UKL4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD2Q9UKL4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJD2Q9UKL4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms