Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ9

GNPTG, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTGQ9UJJ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTGQ9UJJ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTGQ9UJJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTGQ9UJJ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPTGQ9UJJ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPTGQ9UJJ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTGQ9UJJ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPTGQ9UJJ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTGQ9UJJ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPTGQ9UJJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GNPTGQ9UJJ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GNPTGQ9UJJ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNPTGQ9UJJ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTGQ9UJJ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPTGQ9UJJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNPTGQ9UJJ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GNPTGQ9UJJ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPTGQ9UJJ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPTGQ9UJJ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms