Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
STAG3Q9UJ98 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
STAG3Q9UJ98 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
STAG3Q9UJ98 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
STAG3Q9UJ98 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
STAG3Q9UJ98 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
STAG3Q9UJ98 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
STAG3Q9UJ98 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
STAG3Q9UJ98 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
STAG3Q9UJ98 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
STAG3Q9UJ98 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.88■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.83■■■■□ 3.97
STAG3Q9UJ98 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
STAG3Q9UJ98 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
STAG3Q9UJ98 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
STAG3Q9UJ98 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
STAG3Q9UJ98 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
STAG3Q9UJ98 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
STAG3Q9UJ98 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
STAG3Q9UJ98 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
STAG3Q9UJ98 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
STAG3Q9UJ98 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
STAG3Q9UJ98 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
STAG3Q9UJ98 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
STAG3Q9UJ98 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
STAG3Q9UJ98 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
STAG3Q9UJ98 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
STAG3Q9UJ98 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
STAG3Q9UJ98 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
STAG3Q9UJ98 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
STAG3Q9UJ98 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
STAG3Q9UJ98 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
STAG3Q9UJ98 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
STAG3Q9UJ98 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
STAG3Q9UJ98 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
STAG3Q9UJ98 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
STAG3Q9UJ98 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
STAG3Q9UJ98 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
STAG3Q9UJ98 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
STAG3Q9UJ98 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
STAG3Q9UJ98 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
STAG3Q9UJ98 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
STAG3Q9UJ98 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
STAG3Q9UJ98 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
STAG3Q9UJ98 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
STAG3Q9UJ98 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
STAG3Q9UJ98 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
STAG3Q9UJ98 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
STAG3Q9UJ98 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
STAG3Q9UJ98 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.35■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
STAG3Q9UJ98 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
STAG3Q9UJ98 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
STAG3Q9UJ98 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
STAG3Q9UJ98 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
STAG3Q9UJ98 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
STAG3Q9UJ98 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
STAG3Q9UJ98 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
STAG3Q9UJ98 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms