Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 AC138932.1-202ENST00000537889 514 ntTSL 314.97□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 27.1
NOL12Q9UGY1 LRP1-203ENST00000451724 1284 ntTSL 517.45■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 27
NOL12Q9UGY1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 26.8
NOL12Q9UGY1 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-6■■■■■ 26.8
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-216ENST00000534673 848 ntTSL 319.3■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 26.7
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-206ENST00000527530 529 ntTSL 318.91■□□□□ 0.626e-7■■■■□ 26.7
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-202ENST00000524598 940 ntTSL 515.9■□□□□ 0.146e-7■■■■□ 26.7
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 26.5
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 26.5
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 26.5
NOL12Q9UGY1 ACAP3-206ENST00000467278 2725 ntTSL 1 (best)20.32■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 26.3
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-215ENST00000533947 956 ntTSL 519.08■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 26.2
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-209ENST00000529657 842 ntTSL 518.29■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 26.2
NOL12Q9UGY1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 11e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.531e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D9B-207ENST00000518459 954 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D9B-217ENST00000522472 668 ntTSL 513.65□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-213ENST00000568271 752 ntTSL 513.16□□□□□ -0.31e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D9B-205ENST00000518115 548 ntTSL 510.85□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 TBC1D9B-219ENST00000524222 927 ntTSL 510.64□□□□□ -0.711e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.81e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.821e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 PFKFB4-212ENST00000478516 579 ntTSL 39.28□□□□□ -0.921e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-214ENST00000568774 510 ntTSL 29.25□□□□□ -0.931e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-212ENST00000567849 551 ntTSL 54.46□□□□□ -1.71e-7■■■■□ 25.8
NOL12Q9UGY1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.866e-8■■■■□ 25.4
NOL12Q9UGY1 P3H3-211ENST00000612048 2129 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.656e-8■■■■□ 25.4
NOL12Q9UGY1 P3H3-202ENST00000536140 3226 ntTSL 216.22■□□□□ 0.196e-8■■■■□ 25.4
NOL12Q9UGY1 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 221.12■□□□□ 0.976e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.046e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 PHKB-203ENST00000563376 697 ntTSL 314.49□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.476e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 311.41□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.596e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.036e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 PHKB-206ENST00000565424 828 ntTSL 35.95□□□□□ -1.466e-7■■■■□ 24.6
NOL12Q9UGY1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.574e-6■■■■□ 24.5
NOL12Q9UGY1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 24.5
NOL12Q9UGY1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.154e-6■■■■□ 24.5
NOL12Q9UGY1 INPPL1-216ENST00000545355 1124 ntTSL 511.99□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 24.5
NOL12Q9UGY1 INPPL1-203ENST00000535985 353 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 24.5
NOL12Q9UGY1 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 49.84□□□□□ -0.832e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 49.84□□□□□ -0.832e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 47.91□□□□□ -1.142e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 27.75□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.38□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.38□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 24.4
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 24.2
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 24.2
NOL12Q9UGY1 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-79■■■■□ 24.1
NOL12Q9UGY1 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 210.77□□□□□ -0.691e-79■■■■□ 24.1
NOL12Q9UGY1 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-79■■■■□ 24.1
NOL12Q9UGY1 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.811e-79■■■■□ 24.1
NOL12Q9UGY1 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.91e-79■■■■□ 24.1
NOL12Q9UGY1 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 33.99□□□□□ -1.771e-79■■■■□ 24.1
NOL12Q9UGY1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 24.1
NOL12Q9UGY1 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 210.77□□□□□ -0.695e-15■■■■□ 24
NOL12Q9UGY1 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.12□□□□□ -1.115e-15■■■■□ 24
NOL12Q9UGY1 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.145e-15■■■■□ 24
NOL12Q9UGY1 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.315e-15■■■■□ 24
NOL12Q9UGY1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.25e-15■■■■□ 24
NOL12Q9UGY1 AGRN-208ENST00000479707 584 ntTSL 318.13■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 23.7
NOL12Q9UGY1 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 525.94■■□□□ 1.746e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.476e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM132A-210ENST00000540112 2013 ntTSL 223.88■■□□□ 1.416e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.366e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.246e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.036e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM94-211ENST00000579707 566 ntTSL 520.06■□□□□ 0.86e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.766e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM94-230ENST00000584383 500 ntTSL 319.45■□□□□ 0.76e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 218.29■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.456e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM94-214ENST00000580441 513 ntTSL 417.84■□□□□ 0.456e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RRP1-201ENST00000467112 3019 ntTSL 1 (best)17.48■□□□□ 0.396e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.356e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.36e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.266e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM94-232ENST00000585105 5632 ntTSL 215.85■□□□□ 0.136e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM132A-204ENST00000535480 692 ntTSL 314.52□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 STK11-203ENST00000585748 746 ntTSL 313.68□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 213.26□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 TMEM94-229ENST00000583795 557 ntTSL 48.9□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.458e-7■■■■□ 23.6
NOL12Q9UGY1 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 23.4
NOL12Q9UGY1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.99e-7■■■■□ 23.3
NOL12Q9UGY1 NSMF-210ENST00000484316 933 ntTSL 315.1■□□□□ 0.019e-9■■■■□ 23.1
NOL12Q9UGY1 NSMF-209ENST00000482448 551 ntTSL 310.11□□□□□ -0.799e-9■■■■□ 23.1
NOL12Q9UGY1 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC8.9□□□□□ -0.985e-9■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-205ENST00000525724 1864 ntTSL 520.69■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 22.9
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 40.6 ms