Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DKK4Q9UBT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DKK4Q9UBT3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DKK4Q9UBT3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DKK4Q9UBT3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DKK4Q9UBT3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DKK4Q9UBT3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DKK4Q9UBT3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DKK4Q9UBT3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DKK4Q9UBT3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DKK4Q9UBT3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DKK4Q9UBT3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DKK4Q9UBT3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DKK4Q9UBT3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK4Q9UBT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms