Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTR3BQ9P1U1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTR3BQ9P1U1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTR3BQ9P1U1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTR3BQ9P1U1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTR3BQ9P1U1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTR3BQ9P1U1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTR3BQ9P1U1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR3BQ9P1U1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTR3BQ9P1U1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR3BQ9P1U1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR3BQ9P1U1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTR3BQ9P1U1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms