Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0X4

CACNA1I, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1I, humanhuman

Predictions only

Length 2,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1IQ9P0X4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1IQ9P0X4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1IQ9P0X4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1IQ9P0X4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1IQ9P0X4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1IQ9P0X4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1IQ9P0X4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1IQ9P0X4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1IQ9P0X4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1IQ9P0X4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1IQ9P0X4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1IQ9P0X4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1IQ9P0X4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms