Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ING3Q9NXR8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ING3Q9NXR8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ING3Q9NXR8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ING3Q9NXR8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ING3Q9NXR8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms