Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MED17Q9NVC6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED17Q9NVC6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED17Q9NVC6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED17Q9NVC6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED17Q9NVC6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED17Q9NVC6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms