Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLSCR3Q9NRY6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLSCR3Q9NRY6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLSCR3Q9NRY6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLSCR3Q9NRY6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLSCR3Q9NRY6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLSCR3Q9NRY6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms