Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH3

TUBG2, Tubulin gamma-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG2Q9NRH3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG2Q9NRH3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBG2Q9NRH3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBG2Q9NRH3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG2Q9NRH3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBG2Q9NRH3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBG2Q9NRH3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBG2Q9NRH3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBG2Q9NRH3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBG2Q9NRH3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBG2Q9NRH3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBG2Q9NRH3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms