Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTBN5Q9NRC6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SPTBN5Q9NRC6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPTBN5Q9NRC6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPTBN5Q9NRC6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPTBN5Q9NRC6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPTBN5Q9NRC6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTBN5Q9NRC6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTBN5Q9NRC6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTBN5Q9NRC6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPTBN5Q9NRC6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTBN5Q9NRC6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTBN5Q9NRC6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTBN5Q9NRC6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms