Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRCC1Q9NPI7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRCC1Q9NPI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRCC1Q9NPI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRCC1Q9NPI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRCC1Q9NPI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KRCC1Q9NPI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms